隨機光學重建顯微鏡STORM技術可以提供10倍于傳統(tǒng)光學顯微鏡的分辨率,是觀察細胞器乃至生物大分子結構和定位的利器。
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研究介紹
2020年,美國匹茲堡大學的研究人員優(yōu)化了STORM成像方法,并將其用于小鼠腸上皮傳統(tǒng)病理石蠟切片中異染色質結構的觀察,獲得了高質量的超分辨率圖像。研究結果揭示了腫瘤細胞惡變早期的一個標志性特征——染色質高階折疊結構逐漸變得松散和碎片化。這或許對提高癌癥的診斷,分級和預防具有積極作用。
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研究內容(節(jié)選)
許多研究表明異染色質結構的缺陷會導致基因組不穩(wěn)定并增加腫瘤發(fā)生風險。作者使用經過優(yōu)化的STORM成像技術觀察H3K9me3標記的異染色體結構,結合多種測量分析方法,發(fā)現(xiàn)在正常組織中,異染色體形成了高度聚合的大的納米簇,而在腫瘤模型小鼠中,癌變的早期異染色體聚合結構逐漸擴散,提示異染色質結構解體。
圖1、ApcMin/+小鼠模型異染色質結構的超分辨率成像。
作者同時拍攝了野生型和腫瘤模型小鼠腸上皮組織DAPI染色的3D-SIM圖像,并測量了3D染色質結構,與正常組織對比,異染色質區(qū)的熒光強度降低,體積擴散變,共同提示異染色質結構解體。
圖2、野生型小鼠正常細胞和12周ApcMin/+小鼠腫瘤細胞中DAPI染色DNA折疊的3D-SIM圖像。
為了研究異染色質結構破壞對基因穩(wěn)定性和轉錄的影響,作者選擇DNA雙鏈斷裂標記γ-H2AX位點作為觀察對象,發(fā)現(xiàn)來自腫瘤模型小鼠的標本中γ-H2AX位點數(shù)量顯著增加,表明DNA損傷或基因組不穩(wěn)定。作者進一步觀察了癌變過程中活性轉錄因子RNAPII的變化,以及解體后小的DNA納米簇與RNAPII共定位關系,證明腫瘤發(fā)生過程中轉錄活性逐漸增加。
圖3、染色質結構破壞對轉錄和基因組穩(wěn)定性的影響。
圖4、異染色質結構破壞的功能和結構后果。
作者根據(jù)研究結果提出了描述癌變過程中異染色質結構的分子尺度模型。即正常細胞在癌變過程中向腫瘤細胞轉化,染色質折疊逐漸解壓縮、片段化,伴異染色質焦點擴大,從而增強轉錄工廠形成和基因組不穩(wěn)定性。
圖5、描述癌變過程中異染色質結構的分子尺度模型。
